Esta comunicação tem como propósito apresentar uma proposta de pesquisa em estágio inicial acerca do Sertão do Rio São Francisco na Bahia oitocentista. Aqui abordaremos algumas considerações sobre os caminhos metodológicos que seguimos, bem como apresentaremos algumas informações conjunturais que foram coletadas nas fontes. A proposta da pesquisa está centrada na análise da organização política e social do sertão do Rio São Francisco de 1827 (quando o território da comarca do Rio São Francisco foi transferido para a Bahia) até 1896 (quando o senador João Barbalho contesta a posse baiana do território da antiga comarca do Rio São Francisco). Assim, não só estaremos atentos na relação entre o governo imperial com a região do sertão do Rio São Francisco como avançaremos para os debates, nos primeiros anos da república, em torno a posse do território da margem ocidental do rio.